电-气互联系统是提高能源利用效率、实现能源清洁化利用的重要载体。在不确定性愈发复杂交错、影响日益增强的背景下，如何量化分析电-气动态传输过程中的不确定性传递成为亟待解决的问题。为此，提出基于时域嵌入的电-气互联系统仿射动态能流算法，揭示不确定因素对电-气互联系统动态过程的影响机理。首先，基于仿射算术表征不确定因素，构建电-气互联系统仿射动态能流模型；在此基础上，通过时域嵌入重构仿射微分方程组，将仿射微分方程组求解问题转换为能流状态量泰勒幂级数系数递归计算问题，进而递归求解得到仿射能流关于时间的显式表达式；接着，为提升计算效率并降低保守性，提出基于噪声元动态校正的多时段计算方法，获取连续时域的仿射动态能流分布。仿真结果验证所提算法能够从时间维度量化分析源荷不确定性的传递影响，具有精度高、保守度低与计算效率高等优势。