水下无线电能传输系统受水流影响，原副边线圈会有一定的偏移。由于线圈磁心的存在，线圈相对位置的改变会使磁耦合结构参数发生变化，影响系统整体的谐振频率。当逆变器的工作频率与系统的谐振频率不一致时，会导致系统传输功率与传输效率的降低。在串联-串联拓扑无线电能传输系统的基础上，通过计算逆变器前直流母线电流与逆变器输出电压和电流间相角的关系，设计出相应的相角测量电路，并配合通用的梯度下降算法，提出磁耦合结构参数偏移条件下的在线零相角频率跟踪策略。通过一个200 W的无线电能传输系统验证所提方法的可行性和有效性，在30 ms的时间内实现系统的零相角跟踪，功率最高可提高16.24倍，同时效率提高了17.38%。