الحوض هو نظام فضاء مركب يجمع بين السياسة والاقتصاد والاجتماع والثقافة والبيئة، ومن هنا تنبع مطالب مختلفة للمصالح، ويستلزم بشكل عاجل تنفيذ ترتيبات مؤسسية فعالة لتحقيق توازن بين تضارب المصالح. من خلال تحليل خصائص نظام الحوكمة لمنطقة حوض نهر هوايهر، والوضع الحالي، والمشكلات القائمة، ترى المقالة أن هناك مشكلات في بناء نظام الحوكمة الحالي لمنطقة حوض نهر هوايهر مثل عدم وضوح الصلاحيات والمسؤوليات، وعدم كفاية فعالية النظام، وضعف النظام الوظيفي، ويجب تعزيز التكامل المكاني والمنهجي والمؤسساتي لنظام الحوكمة على مستوى الحوض.