大型水电站项目具有投资规模大、建设周期长、技术复杂度高、参与主体多及生态影响广等特点，档案管理面临“重施工、轻档案”、多主体协同难等现实问题，直接影响工程合规性验收与后期运维。保障工程档案管理的系统性、完整性迫在眉睫。文章深入分析了水电站档案在载体多样性、周期长期及专业规范性等方面的显著特点，揭示了当前档案管理中面临的收集不完整、整理不规范、协同困难、保管利用难度大、复合型人才短缺等现实难点。提出了以党建引领为统领，健全管理体系、强化全过程管控、优化多方协同机制、推进数字化转型、加强人才培养及完善保管利用体系等系统性提升策略。能有效解决档案管理中的诸多难题，实现“以资料管过程、以过程保质量、以档案促运营”研究成果可为大型水电站项目档案的标准化与智能化管理提供实践参考。