为有效应对新能源出力、负荷需求等多种不确定量同时波动对多能微电网系统安全稳定运行带来的影响，提出一种考虑协变量因素的多能微电网两阶段分布鲁棒优化模型。首先，基于分布鲁棒优化方法，初步构建包含光伏发电机组、冷热电联产机组、冷热电负荷和热储能的多能微电网系统两阶段优化调度模型；然后，考虑协变量因素，建立基于多元决策树回归的Wasserstein模糊集，刻画源荷双侧不确定量之间、不确定量与协变量因素之间的内在联系；接着，运用线性决策规则及对偶定理，给出模型的混合整数线性规划形式；最后，将模型应用于33节点多能微电网系统进行算例分析。结果表明，相比于经典鲁棒优化和分布鲁棒优化模型，引入协变量因素能够有效提高模型的经济性。在蒙特卡洛样本外测试中，所提出的两阶段分布鲁棒优化模型对不确定量波动表现出良好的可靠性。